La colección cuenta especímenes de moluscos marinos, dulceacuícolas y terrestres. Moluscos Marinos: contiene 8,658 especímenes ingresados (2,063 ejemplares del Pacífico y 6,375 ejemplares del Atlántico), colectados entre 1994-2004. Estos moluscos pertenecen a las clases Gastropoda, Bivalvia y Scaphopoda, siendo Lucinidae, Ungulinidae, Cardiidae y Veneridae las familias principales. Los sitios más representados son los departamentos de Retalhuleu, San Marcos, Santa Rosa e Izabal. / Moluscos Terrestres: contiene 967 ejemplares de caracoles colectados entre 2011 y 2012. Estos pertenecen a la clase Gastropoda, siendo Helicinidae, Neocyclotidae y Subulinidae las familias más representadas. Los sitios más representados son los departamentos de Petén, Huehuetenango y Alta Verapaz. / Moluscos Dulceacuícolas: la mayor parte de los ejemplares no se han determinado y están pendientes de ingreso.